MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 5522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014002	TTA	2	6	1210217	1210222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014002	AT	3	6	1212178	1212183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014002	AGA	2	6	1212206	1212211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014002	AT	3	6	1212218	1212223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014002	T	6	6	1212308	1212313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014002	CAAATT	2	12	1212355	1212366	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3507	NC_014002	CTG	2	6	1212404	1212409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014002	TTG	2	6	1212591	1212596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014002	TCT	2	6	1212700	1212705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_014002	TTG	2	6	1212707	1212712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014002	TAA	2	6	1212755	1212760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014002	ATT	2	6	1212789	1212794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014002	CAG	2	6	1214273	1214278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_014002	ATTCCA	2	12	1214279	1214290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_014002	CATA	2	8	1214334	1214341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_014002	AT	3	6	1214344	1214349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014002	TA	3	6	1214362	1214367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014002	TAAT	2	8	1214388	1214395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014002	TTA	2	6	1214407	1214412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014002	AATT	2	8	1215610	1215617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014002	A	6	6	1216529	1216534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014002	ATA	2	6	1216575	1216580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014002	AAC	2	6	1216582	1216587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_014002	GCCC	2	8	1216620	1216627	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3525	NC_014002	ACC	2	6	1216658	1216663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_014002	TTG	2	6	1216665	1216670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014002	CCGG	2	8	1216689	1216696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_014002	T	7	7	1216706	1216712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014002	ATA	2	6	1216719	1216724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_014002	AT	3	6	1217729	1217734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014002	TTG	2	6	1217744	1217749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_014002	ATA	2	6	1217797	1217802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_014002	A	6	6	1217804	1217809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_014002	TAT	2	6	1221969	1221974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014002	A	9	9	1225465	1225473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014002	CTA	2	6	1225885	1225890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_014002	A	6	6	1225900	1225905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014002	TAA	2	6	1227132	1227137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_014002	GGTT	2	8	1227139	1227146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014002	AT	3	6	1227152	1227157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014002	A	6	6	1227193	1227198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_014002	A	6	6	1227250	1227255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014002	ATG	2	6	1227266	1227271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014002	TACA	2	8	1227316	1227323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_014002	ATA	2	6	1231800	1231805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014002	ATT	2	6	1232466	1232471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_014002	AGA	2	6	1233986	1233991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_014002	TTA	2	6	1233999	1234004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014002	ATTAC	2	10	1234015	1234024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_014002	TCC	2	6	1234481	1234486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_014002	AT	4	8	1234587	1234594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_014002	TAT	2	6	1235910	1235915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014002	ATA	2	6	1235920	1235925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014002	ATGCC	2	10	1235940	1235949	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3555	NC_014002	CAC	2	6	1235983	1235988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_014002	AAG	2	6	1235993	1235998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014002	A	6	6	1236009	1236014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014002	AC	3	6	1236333	1236338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_014002	A	6	6	1236377	1236382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014002	GAA	2	6	1236383	1236388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014002	ACT	2	6	1236392	1236397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_014002	T	7	7	1236634	1236640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014002	AGTT	2	8	1239737	1239744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_014002	ATA	2	6	1239747	1239752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014002	T	6	6	1239767	1239772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_014002	TAT	2	6	1243892	1243897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_014002	ACCG	2	8	1243909	1243916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_014002	TA	3	6	1243928	1243933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014002	AAT	2	6	1243986	1243991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014002	TAA	2	6	1246942	1246947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014002	A	7	7	1246946	1246952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_014002	TGT	2	6	1247312	1247317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014002	TA	5	10	1247318	1247327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014002	TAA	2	6	1247395	1247400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_014002	CAA	2	6	1247420	1247425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_014002	CCA	2	6	1247475	1247480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_014002	TTTAC	2	10	1247487	1247496	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3578	NC_014002	CCTT	2	8	1249744	1249751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_014002	GATA	2	8	1249776	1249783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014002	ATAA	2	8	1250306	1250313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014002	CTGT	2	8	1250341	1250348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3582	NC_014002	A	6	6	1250369	1250374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_014002	ACAA	2	8	1250385	1250392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_014002	AT	3	6	1250746	1250751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014002	AGA	2	6	1250789	1250794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_014002	AAT	2	6	1250827	1250832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_014002	GGCG	2	8	1250853	1250860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_014002	AGG	2	6	1250892	1250897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014002	GCC	2	6	1250900	1250905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_014002	AAATC	2	10	1250979	1250988	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3591	NC_014002	GTA	2	6	1251395	1251400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_014002	TAT	2	6	1251409	1251414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014002	TAAA	2	8	1251415	1251422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014002	ATG	2	6	1251426	1251431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014002	TGT	2	6	1251660	1251665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014002	TA	3	6	1251707	1251712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014002	TAAAA	2	10	1252805	1252814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014002	AAG	2	6	1252865	1252870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_014002	AT	4	8	1252950	1252957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014002	TAGA	2	8	1252975	1252982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_014002	ATA	2	6	1253313	1253318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014002	ATC	2	6	1254225	1254230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_014002	TC	3	6	1254320	1254325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_014002	GAA	2	6	1254338	1254343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014002	CAAG	2	8	1254402	1254409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_014002	AGA	2	6	1254423	1254428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014002	A	7	7	1254431	1254437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014002	TCA	2	6	1254442	1254447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_014002	ATTT	2	8	1254454	1254461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_014002	TTC	2	6	1254463	1254468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_014002	CAT	2	6	1256535	1256540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_014002	ATAA	2	8	1256562	1256569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_014002	ATT	2	6	1256581	1256586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014002	TTA	2	6	1256619	1256624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014002	A	7	7	1256653	1256659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014002	ATT	2	6	1257054	1257059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014002	GAAA	2	8	1257090	1257097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014002	T	7	7	1257119	1257125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_014002	TAT	2	6	1257134	1257139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_014002	GGA	2	6	1257159	1257164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_014002	TCA	2	6	1257172	1257177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_014002	TTC	2	6	1257231	1257236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_014002	T	7	7	1257243	1257249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_014002	TTTA	2	8	1257324	1257331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_014002	TAA	2	6	1257346	1257351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_014002	CTT	2	6	1257447	1257452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_014002	AGGGA	2	10	1257559	1257568	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_014002	CTGG	2	8	1257621	1257628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_014002	TGT	2	6	1257644	1257649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_014002	TA	4	8	1257674	1257681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_014002	ATA	2	6	1257752	1257757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_014002	CCT	2	6	1259015	1259020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3633	NC_014002	CCT	2	6	1260041	1260046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3634	NC_014002	TA	3	6	1260160	1260165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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